В 1991 году отдел пожарной охраны УВД Брянского облисполкома в соответствии с приказом МВД РСФСР от 15 мая 1991 года № 64 был преобразован в противопожарную аварийно-спасательную службу УВД Брянской области.

В 1993 году противопожарная аварийно-спасательная служба УВД Брянской области в соответствии с приказом МВД РФ от 6 ноября 1993 года № 460 и приказом УВД Брянской области от 30 ноября 1993 года № 450 преобразована в Управление Государственной противопожарной службы УВД Брянской области.

С 1 января 2002 года Управление Государственной противопожарной службы УВД Брянской области перешло в ведение Министерства Российской Федерации по делам гражданской обороны, чрезвычайным ситуациям и ликвидации последствий стихийных бедствий.

В 2003 году Управление Государственной противопожарной службы в соответствии с Директивой МЧС России от 24 сентября 2003 года  включено в состав Главного управления по делам гражданской обороны и чрезвычайным ситуациям Брянской области.

На базе Главного управления по делам гражданской обороны и чрезвычайным ситуациям Брянской области в соответствии с Постановлением администрации Брянской области от 6 мая 2005 года № 242 «О создании комитета гражданской защиты и пожарной безопасности Брянской области создано Брянское областное государственное учреждение «Брянский пожарно-спасательный центр».

На момент создания в учреждение входили помимо аппарата управления 5 отрядов государственной противопожарной службы, отряд технической службы и 24 пожарных части.

В июле 2005 года в структуре учреждения создана водолазно-спасательная служба.

С 1 января 2009 года в учреждение переданы 25 отдельных постов ГУ «Лесопожарная  служба Брянской области»

С 14 января 2011 года в соответствии с постановлением администрации Брянской области от  5 октября 2010 года № 1003 «О создании казенных учреждений путем изменения типа действующих бюджетных учреждений» изменен тип существовавшего Брянского областного государственного учреждения «Брянский пожарно-спасательный центр» на государственное казенное учреждение Брянской области «Брянский пожарно-спасательный центр».